MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017291	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017291	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017291	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017291	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017291	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017291	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017291	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017291	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017291	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017291	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017291	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017291	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017291	T	6	6	6676	6681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017291	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017291	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017291	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017291	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017291	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017291	TTA	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017291	AAT	2	6	17009	17014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017291	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017291	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017291	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017291	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017291	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017291	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017291	T	6	6	20378	20383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017291	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017291	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017291	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017291	T	9	9	21770	21778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017291	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017291	T	6	6	21810	21815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017291	T	7	7	23803	23809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017291	A	6	6	23887	23892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017291	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017291	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017291	T	7	7	26579	26585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017291	TTC	2	6	26615	26620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017291	ATTT	2	8	26656	26663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017291	ATTA	2	8	26667	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017291	A	6	6	30340	30345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017291	TTTC	2	8	31652	31659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017291	AGG	2	6	31746	31751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017291	T	6	6	31770	31775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017291	TC	3	6	31852	31857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017291	AGA	2	6	31969	31974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017291	CTT	2	6	31984	31989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017291	TCTA	2	8	32056	32063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017291	A	6	6	32365	32370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017291	AATT	2	8	32380	32387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017291	AAT	2	6	32409	32414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017291	TTAA	2	8	32420	32427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017291	TTA	2	6	33430	33435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017291	AAG	2	6	33451	33456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017291	A	6	6	33507	33512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017291	TTAA	2	8	33516	33523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017291	TGT	3	9	33530	33538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017291	AGAT	2	8	33559	33566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017291	AAG	2	6	33575	33580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017291	ATTTAA	2	12	33598	33609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017291	TGG	2	6	34232	34237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017291	ATAAA	2	10	34287	34296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017291	A	6	6	34304	34309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017291	TTC	2	6	37591	37596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017291	TTC	2	6	37632	37637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017291	TGC	2	6	37680	37685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017291	TC	3	6	37742	37747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017291	TCAA	2	8	37781	37788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017291	AGA	2	6	37870	37875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017291	TAT	2	6	38105	38110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017291	GAA	2	6	39481	39486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017291	TTA	2	6	42387	42392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017291	GAA	2	6	42409	42414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017291	AGT	2	6	42698	42703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017291	TTTTAA	2	12	42721	42732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017291	CAA	2	6	42773	42778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017291	A	6	6	43438	43443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017291	GTT	2	6	43450	43455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017291	GAC	2	6	44142	44147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017291	ACG	2	6	44177	44182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017291	GTCG	2	8	44200	44207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017291	GTC	2	6	44218	44223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017291	GAA	2	6	49513	49518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017291	ATAA	2	8	49533	49540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017291	A	6	6	49542	49547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017291	TA	3	6	52216	52221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017291	GAT	2	6	52232	52237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017291	TCG	2	6	52299	52304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017291	TTG	2	6	52314	52319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017291	T	6	6	52330	52335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017291	T	8	8	52365	52372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017291	GTC	2	6	52418	52423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017291	A	6	6	52454	52459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017291	TTTTG	2	10	52489	52498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017291	AAG	2	6	52518	52523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017291	AAAG	2	8	52613	52620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017291	TTTA	2	8	52623	52630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017291	GAAG	2	8	52726	52733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017291	CCT	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017291	T	6	6	52748	52753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017291	TGC	2	6	52814	52819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017291	CCT	2	6	52820	52825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017291	TGC	2	6	52826	52831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017291	AGG	2	6	52845	52850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017291	A	6	6	54481	54486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017291	T	7	7	54506	54512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017291	AAT	2	6	54534	54539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017291	AAAG	2	8	54791	54798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017291	TGG	2	6	57865	57870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017291	TTAAT	2	10	57969	57978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017291	GGT	2	6	58094	58099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017291	A	8	8	58103	58110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017291	ATT	2	6	59560	59565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017291	TTA	2	6	59587	59592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017291	A	6	6	59609	59614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017291	TAA	2	6	59661	59666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017291	AGA	2	6	59737	59742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017291	GTTT	2	8	59897	59904	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017291	TATG	2	8	59912	59919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017291	CTA	2	6	59976	59981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017291	CAA	2	6	63300	63305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017291	TG	3	6	63309	63314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017291	TTG	2	6	64381	64386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017291	A	8	8	64391	64398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017291	GAA	2	6	64409	64414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017291	TCC	2	6	64494	64499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017291	CTTT	2	8	64572	64579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017291	AAT	2	6	64640	64645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017291	GATA	2	8	70220	70227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017291	AG	3	6	70239	70244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017291	GTC	2	6	70294	70299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017291	AGA	2	6	70338	70343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017291	T	7	7	71076	71082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017291	A	7	7	71126	71132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017291	CACTT	2	10	71134	71143	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017291	ATA	2	6	71242	71247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017291	T	6	6	72127	72132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017291	TTA	3	9	74094	74102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017291	ATC	2	6	76091	76096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017291	TCA	2	6	77416	77421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017291	TTC	2	6	77493	77498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017291	TAT	2	6	77525	77530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017291	TAAT	2	8	77665	77672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017291	TATT	2	8	77682	77689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017291	TTAA	2	8	77691	77698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017291	TAAA	2	8	77722	77729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017291	ATTA	2	8	77739	77746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017291	AATTT	2	10	77747	77756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017291	T	6	6	87464	87469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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